Situado nos anos que antecederam os eventos explosivos de Duna, Duna: A Casa Atreides transporta os leitores para um futuro distante no planeta deserto Arrakis, onde Pardot Kynes busca seus segredos. Enquanto isso, um golpe violento é planejado pelo filho do imperador Elrood; um escravo de oito anos, Duncan Idaho, procura escapar de seus mestres cruéis; e um jovem chamado Leto Atreides inicia uma jornada fatídica. Essas almas improváveis se unirão como renegadas e logo descobrirão que o destino decretou que elas mudarão a própria forma da história.